成(chéng)都(dōu)市疾病預防控制中心
“**區新增一例新冠密切接觸者，從**市轉入。”在成(chéng)都(dōu)市疾病預防控制中心新冠肺炎疫情應急指揮中心，新冠肺炎密切接觸者采集分析系統發(fā)出新的提示。庹曉莉緊盯電腦屏幕，一刻不松懈的緊張工作著(zhe)。
這(zhè)套密切接觸者數據采集分析系統是庹曉莉和團隊緊急科研攻關的成(chéng)果，從研發(fā)到上線，僅僅用了72小時。
正在運行的這(zhè)套“成(chéng)都(dōu)市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時采集分析系統”也是成(chéng)都(dōu)市疾控中心承擔的科技攻關項目中的重要一部分，得到了成(chéng)都(dōu)市科學(xué)技術局的大力支持，在當下的疫情防控中發(fā)揮了重要作用。
當庹曉莉在新冠肺炎疫情應急指揮中心緊張地負責調度指揮的同時，
嶽勇正換上全套裝備，準備前往隔離點對(duì)疑似病例展開(kāi)流行病學(xué)調查，
而此刻，杜長(cháng)慧正在和同事(shì)一起(qǐ)開(kāi)會，研究病毒的時空分布規律。
三個人，三個鏡頭，40天
不同的畫面(miàn)，卻指向(xiàng)相同的目标
爲抗擊新冠肺炎，成(chéng)都(dōu)啓動首批8個應急科技攻關項目，成(chéng)都(dōu)市疾控中心承擔的“成(chéng)都(dōu)地區新型冠狀病毒疫情應急響應模式的構建及應用”即是其中之一。
構建成(chéng)都(dōu)市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時采集分析系統
掌握成(chéng)都(dōu)市新冠疫情的流行特征
探索成(chéng)都(dōu)市新冠病毒肺炎的時空分布規律……
這(zhè)些，都(dōu)是這(zhè)個應急科技攻關項目中的重要組成(chéng)部分。
如今，作爲抗擊新冠肺炎的“排頭兵”，像庹曉莉、嶽勇、杜長(cháng)慧的一樣(yàng)的疾控人，正在和時間賽跑，在一線戰“疫”的同時，群策群力推動應急科技攻關。
他們“連軸轉”了1個多月，每天工作超過(guò)16個小時，熬過(guò)數不清的夜……而他們的目标隻有一個，希望用科技賦能(néng)戰“疫”，希望勝利的曙光早日來臨。
初次見到庹曉莉，幹練、冷靜，是她給人的第一印象。
在辦公室裡(lǐ)，她一直對(duì)著(zhe)電腦，不斷地記錄著(zhe)各種(zhǒng)數據，在簡單的交流中，她語速不急不緩、條理清晰。
作爲成(chéng)都(dōu)市疾控中心應急與業務管理辦公室主任，這(zhè)樣(yàng)的沉著(zhe)，成(chéng)爲了她“應急”的底氣。
從2003年的SARS
到2008年的“5.12”特大地震
從禽流感
到甲型H1N1流感疫情……
見慣過(guò)“大場面(miàn)”的庹曉莉，一直都(dōu)是在突發(fā)公共衛生事(shì)件中沖鋒在前的“逆行戰士”。
而這(zhè)一次，也不例外。
突如其來的新冠肺炎疫情，讓今年的大年三十和往常不太一樣(yàng)，而對(duì)于庹曉莉來說，更是特别，因爲，這(zhè)一天，正好(hǎo)是她的生日。
已經(jīng)連軸轉了9天的庹曉莉，卻早已忘記，直到丈夫在電話那端提起(qǐ)。
這(zhè)一天，她在心裡(lǐ)默默許下生日願望，望這(zhè)一場疫情早日結束，望不再有人經(jīng)受病魔的折磨。
這(zhè)一夜，她還(hái)是與她的團隊一起(qǐ)在崗位上工作直到天亮。
庹曉莉駐守的成(chéng)都(dōu)市疾控中心新型冠狀肺炎疫情應急指揮中心，每天要處理大量信息和指令，串聯起(qǐ)疫情防控公共衛生響應全鏈條，是疾控指揮調度及信息彙總分析的樞紐，成(chéng)都(dōu)市每日新冠肺炎疫情最新情況的數據即來源于此。
每天工作超過(guò)13個小時，有時候甚至通宵加班，電話24小時在線，這(zhè)早已成(chéng)爲庹曉莉工作的常态。
對(duì)密切接觸者追蹤管理，是疫情防控中的重要環節。如何精準的做到信息共享和統計分析，更是成(chéng)爲了疫情決策的關鍵。
随著(zhe)疫情的蔓延，一面(miàn)是急劇增加的密接者人數，一面(miàn)是要快速獲取信息和精準統計的工作要求，如何解決這(zhè)一“瓶頸”？成(chéng)爲了擺在庹曉莉和她團隊面(miàn)的一道(dào)難題。
庹曉莉坦言：“最開(kāi)始我們采取的是人工統計報表的方式，随著(zhe)新冠病人的數量增多，密切接觸者的數量也越來越龐大，這(zhè)給9個人的追蹤統計工作組帶來很大挑戰。”
3天，72小時，用科技賦能(néng)疫情防控
在成(chéng)都(dōu)市科技局應急攻關項目的支持下，庹曉莉和團隊當機立斷，決定在已有的疾病監測系統上，新建一個針對(duì)新冠密切接觸者的實時采集分析系統。
“時間就是生命，我們必須分秒必争。”庹曉莉說，我和我的團隊每天都(dōu)見縫插針與研發(fā)團隊商量、讨論，修改……目的就是讓這(zhè)個系統能(néng)夠盡快上線。
僅僅用了3天時間，成(chéng)都(dōu)市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時采集分析系統1.0版上線，它將(jiāng)所有确診病例、疑似病例以及密切接觸者納入一個完整的數據庫，分級分類管理，快速追蹤。
獲取密接者信息的速度大大加快了；
密切接觸者追蹤管理效率大大提高；
信息組數據采集彙總分析效能(néng)大大增強；
科技化手段對(duì)疫情防控工作帶來的效率提升立竿見影。
庹曉莉說：“目前我們管理的密接者累計已達到6000多人，在管的還(hái)有數百餘人。可以想象，這(zhè)麼(me)大工作量，如果沒(méi)有這(zhè)個信息系統，要完成(chéng)實時信息共享和精準分析，靠再多的人都(dōu)實現不了。”
當然，努力并沒(méi)有止步于此，庹曉莉和其團隊還(hái)在計劃不斷完善系統功能(néng)。
“一方面(miàn)，系統采集信息的功能(néng)息需要完善。比如，現在關注‘返崗複工’人員的情況，我們的系統也會增加相關數據的采集。另一方面(miàn)，系統的統計分析的功能(néng)也需要不斷完善，爲我們深入分析新冠肺炎疫情特征提供支撐。”
庹曉莉說，下一步，他們還(hái)計劃聚焦數據的可視化呈現，把“枯燥”的數字代表的意義表達出來。而在未來，其他的傳染病防控，這(zhè)套系統也將(jiāng)繼續發(fā)揮重要作用。
和庹曉莉的采訪，隻持續了短短30分鍾，她就連忙趕回了應急指揮中心。
事(shì)後(hòu)我們才得知，這(zhè)個春節，她本來計劃和丈夫帶著(zhe)雙胞胎兒子回老家湖北十堰看望父母……但疫情發(fā)生後(hòu)，她默默退掉了回鄉的火車票，取消了已經(jīng)定下的出國(guó)旅遊行，義無反顧的投身到“疫”戰第一線。湖北十堰也是疫情高發(fā)地區，實施了戰時封閉管理，她雖然心中牽挂愧疚獨自在家、年邁且身體不好(hǎo)的父母，但隻有用電話給遠方的老人互報平安，往往說不到兩(liǎng)句，就被(bèi)工作打斷。
距離“臨危受命”，已經(jīng)過(guò)去了40多天，庹曉莉和她的團隊還(hái)在應急指揮中心的辦公大廳裡(lǐ)熬著(zhe)最深的夜，被(bèi)遺忘的生日，被(bèi)取消的旅行，隻爲期待爲疫情勝利那一天帶來的光亮。
“你再好(hǎo)好(hǎo)想想，你過(guò)去14天到底去了哪些地方？”
“你搭乘了哪些交通工具？接觸了哪些人？”
“你去過(guò)哪些人員密集的地方？”
“你吃飯的時候和誰坐在一起(qǐ)，和誰說了話？”
……
自新冠肺炎疫情爆發(fā)以來，嶽勇所帶領的成(chéng)都(dōu)市疾控中心流行病學(xué)調查組，就早已奔波各處醫院、隔離點。而這(zhè)樣(yàng)的現場調查，每一例短則2-3小時，多則甚至要3-5小時。
隔著(zhe)密不透風的防護服，艱難的記錄著(zhe)每一次問答，他們隻爲找到“蛛絲馬迹”，迅速确定所有密切接觸者。
嶽勇，是成(chéng)都(dōu)市疾控中心流行病學(xué)調查組副組長(cháng)、傳防科副科長(cháng)，先後(hòu)經(jīng)曆了2009年甲型H1N1流感疫情、2014年西非埃博拉暴發(fā)、中東呼吸綜合征、2017年人感染H7N9禽流感等重大的新發(fā)傳染病疫情處置的他，對(duì)一線傳染病防控有著(zhe)豐富的經(jīng)驗。而這(zhè)次他和他的團隊，也成(chéng)爲了這(zhè)樣(yàng)一群在疫情“一線”與時間、與疾病“賽跑”的疾控人。
時間回溯到1月15日，嶽勇和他科室的12人，就全部進(jìn)入了“備戰”狀态。
白天，在疫情一線，詢問确診和疑似病例過(guò)去14天的活動軌迹和接觸人員，展開(kāi)流行病學(xué)調查；
晚上，在辦公室，形成(chéng)調查報告，分析可能(néng)的感染來源，初步預判高危風險的密切接觸者，提出下一步工作開(kāi)展方向(xiàng)……
嶽勇和他的團隊，從疫情暴發(fā)以來就一直沖鋒在第一線，白天黑夜連軸轉，很多時候都(dōu)把辦公室當家，住在這(zhè)裡(lǐ)。
在每日更新的“疫情地圖”中，大家都(dōu)密切關注著(zhe)：有多少例确診？有多少例疑似？又有多少密切接觸者，他們都(dōu)出現在哪裡(lǐ)？
在本次疾控中心承擔的成(chéng)都(dōu)市應急科技攻關項目中，即提出要“掌握成(chéng)都(dōu)市新冠疫情的流行特征”、“通過(guò)典型的聚集性疫情案例，探索分析新型冠狀病毒的傳播模式”……而要弄清這(zhè)些問題，嶽勇和他的團隊正在進(jìn)行的流行病學(xué)調查就至關重要。
“流調”即流行病學(xué)調查。學(xué)術上解釋爲，用流行病學(xué)方法進(jìn)行的調查研究。主要用于研究疾病、健康和衛生事(shì)件的分布及其決定因素。通過(guò)這(zhè)些研究提出合理的預防保健對(duì)策和健康服務措施，并評價這(zhè)些對(duì)策和措施的效果。
在嶽勇辦公室裡(lǐ)，最顯眼的是一面(miàn)比人高的支架式寫字闆，上面(miàn)密密麻麻畫著(zhe)确診病例的“人物關系圖”，而這(zhè)是一張經(jīng)過(guò)數個小時的詢問，最終畫出的關系圖：
以核心病例的發(fā)病時間爲放射線，往前推算14天内，從病例日常生活軌迹中尋找蛛絲馬迹，分析可能(néng)的感染來源，便于及時控制傳染源；
往後(hòu)至調查當日，詳細調查病例的所有活動軌迹，經(jīng)曆的事(shì)，遇到的人，具體到時間點均要調查，便于判斷可能(néng)的密切接觸者。
所有大型聚會接觸到的人，以及他們的密切接觸者，都(dōu)在這(zhè)張“人物關系圖”上。
“從某種(zhǒng)意義上來講，流行病學(xué)調查與刑警辦案一樣(yàng)，越快地排查鎖定‘嫌疑人’就越有利于案件偵破或減少案件的再發(fā)。”
嶽勇說，我們會把疑似或确診病例的行動軌迹、傳染案例畫成(chéng)關系圖，分析全市所有确診病例傳染路徑、地區分布、人群特點；然後(hòu)通過(guò)大數據，最終形成(chéng)“流調”報告，提出合理的預防對(duì)策和健康服務措施。
“目前我們對(duì)新冠病毒的了解有限，還(hái)需要不斷的加深認識。這(zhè)需要我們在開(kāi)展流調中，對(duì)每一個疑似或者确診病例展開(kāi)調查，以盡可能(néng)細緻地摸清他們的行動軌迹，找到其他密切接觸者，并從流行病學(xué)上分析病毒特征，最終形成(chéng)資料報告。”
在嶽勇看來，“隻有這(zhè)些工作做的越深入，信息越細緻，盡快掌握一手資料，才能(néng)爲疫情防控提供支撐，并形成(chéng)有效的防控經(jīng)驗。”
“2月**日，成(chéng)都(dōu)新增0例确診病例……”來自嶽勇和他團隊提供的這(zhè)份數據，是每一天清晨，我們最關注的信息。
“流調”是一項瑣碎、細緻的工作，但是至關重要，嶽勇和他的團隊，如今依然“戰鬥”在疫情一線，而他們形成(chéng)的一個個“流調”報告，也正在爲科研攻關提供著(zhe)有力的數據支撐。
在疾控中心微檢科收樣(yàng)室
杜長(cháng)慧在緊張有序審讀區縣随同标本一起(qǐ)上交的流調報告的間隙，還(hái)在抓緊時間構思測試GIS技術和時空分析方法在疫情防控中如何發(fā)揮作用。在他的電腦屏幕上，顯示的是一張成(chéng)都(dōu)市地圖，而他所做的，正是希望把新冠病毒的時空分布規律在地圖上展示出來，爲我們更好(hǎo)了解新冠病毒的地域傳播，提供一個新的破題思路。
爲了進(jìn)一步提高流調報告的質量，杜長(cháng)慧在收樣(yàng)室審讀上送标本的流調報告，溝通區縣流調人員補充報告中需要完善的地方。從大量的流調報告中，杜長(cháng)慧發(fā)現被(bèi)調查對(duì)象的個體傳播軌迹迫切需要一種(zhǒng)展示技術，他邊審讀報告，邊整理個體傳播軌迹的表現形式，一遍又一遍用各種(zhǒng)GIS方法和技術進(jìn)行研究和測試，以期盡早給出一套成(chéng)熟的展示技術用于現在的疫情防控。
在已掌握的數據基礎上，如何形成(chéng)對(duì)病毒規律進(jìn)一步的系統認識？杜長(cháng)慧團隊和微生物檢驗科正在通力協作，計劃借助GIS地理信息系統，結合病原基因測序與進(jìn)化分析，對(duì)病毒傳播進(jìn)行分子溯源，探索病例的傳播模式及病毒進(jìn)化的時空分布規律。
作爲牽頭人之一，杜長(cháng)慧和團隊成(chéng)員已完成(chéng)了大量的方法和技術測試和準備，數據整理和分析也在有序開(kāi)展。據杜長(cháng)慧介紹，此前團隊也計劃在成(chéng)都(dōu)地區諾如病毒的分子流行病學(xué)研究引入GIS系統，以研究病毒進(jìn)化時空分布規律，已積累了一定的研究基礎，此次也希望通過(guò)這(zhè)項技術爲新冠疫情防控提供幫助和支持。
“一邊是整體，我們正在利用GIS系統，將(jiāng)探索成(chéng)都(dōu)市新冠病毒肺炎的時空分布規律，從群體角度構建其時空分析模式。”
“一邊是個體，我們通過(guò)前期數據搜集，新冠肺炎感染者去過(guò)哪？接觸過(guò)誰？在哪停留過(guò)？……通過(guò)對(duì)個體流調信息的梳理，從個案出發(fā)，構建個體傳播軌迹展示技術。”
杜長(cháng)慧詳細的介紹著(zhe)他們正在進(jìn)行的科技攻關，我們從整體和個體兩(liǎng)方面(miàn)，可以幫助我們對(duì)新冠病毒在成(chéng)都(dōu)的傳播地域特點有更清楚的認識。
與此同時，經(jīng)過(guò)前期收集病例和密接的流行病學(xué)信息、采集病例的标本，微生物檢驗科將(jiāng)建立基因測序方法，挑選合格标本進(jìn)行測序與進(jìn)化分析，整理并數字化流調信息。最終，在GIS系統和分子溯源技術的助推下，將(jiāng)有望展示新冠病毒的傳播模式及病毒進(jìn)化的時空分布規律。
一環扣一環的科技攻關，將(jiāng)不僅爲我們探索新型冠狀病毒的傳播機制提供研究基礎，也將(jiāng)爲未來疫情防控與政府決策提供科學(xué)依據。
作爲成(chéng)都(dōu)市科技局首批啓動的8個應急科技攻關項目之一，成(chéng)都(dōu)市疾控中心承擔的是“成(chéng)都(dōu)地區新型冠狀病毒疫情應急響應模式的構建及應用”。目前，該項目已經(jīng)細分成(chéng)7個闆塊的内容，正在分步推進(jìn)科技攻關。
據了解，成(chéng)都(dōu)市疾控中心正在集結全部力量，展開(kāi)科研應急攻關，“成(chéng)都(dōu)市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時采集分析系統”從研發(fā)到上線，僅僅花了72小時，這(zhè)爲成(chéng)都(dōu)目前的新冠肺炎疫情防控提供了重要的支撐作用。
而涉及的流行病學(xué)調查，也在全面(miàn)開(kāi)展中，通過(guò)流調將(jiāng)掌握成(chéng)都(dōu)市新冠疫情的流行特征、了解新冠病毒感染的嚴重程度、分析新冠感染的傳播能(néng)力等。
另外，成(chéng)都(dōu)市疾控中心正在利用GIS系統，探索成(chéng)都(dōu)市新冠病毒肺炎的時空分布規律，從群體角度構建其時空分析模式；同時，在展開(kāi)病毒檢測的基礎上，實驗室還(hái)將(jiāng)結合病原基因測序與進(jìn)化分析，對(duì)病毒傳播進(jìn)行分子溯源，探索病例的傳播模式及病毒進(jìn)化的時空分布規律。
接下來，《走進(jìn)科技戰“疫”一線》將(jiāng)走進(jìn)這(zhè)次應對(duì)新冠肺炎疫情的“前沿陣地”——成(chéng)都(dōu)市公共衛生臨床醫療中心和四川邁克生物科技股份有限公司，給大家帶來第一手的科技“疫”線“戰報”。
圖據受訪者，部分圖源網絡
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